Разнообразие организационных механизмов программного управления предполагало вместе с тем определенное единство в их функционировании. Целевые органы должны были нести всю полноту ответственности за выполнение каждой программы. Они должны были наделяться полномочиями по рассмотрению и утверждению планов реализации программ в целом и отдельных подпрограмм, распределению выделенных ресурсов между участниками программного цикла, изданию распоряжений, обязательных для исполнения соответствующими организационными и производственными единицами— субъектами подготовки и выполнения программных решений, осуществлению контроля за реализацией программ.